MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 12182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013159	CTG	2	6	11	16	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013159	GAGGG	2	10	77	86	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013159	AGC	2	6	93	98	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013159	TCG	2	6	1895	1900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013159	A	7	7	2020	2026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013159	TGGA	2	8	2272	2279	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013159	TGA	2	6	2393	2398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013159	GCT	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013159	CA	3	6	2420	2425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013159	TAC	3	9	2438	2446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013159	TC	3	6	2456	2461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013159	AGA	3	9	2466	2474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013159	A	7	7	2474	2480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013159	CAC	2	6	2654	2659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_013159	TCA	2	6	2699	2704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013159	CA	3	6	2703	2708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013159	TCG	2	6	2713	2718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013159	CGA	2	6	6025	6030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013159	GT	3	6	7046	7051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013159	GAG	2	6	7066	7071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013159	CGA	2	6	11633	11638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013159	CGG	2	6	12408	12413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013159	GCT	2	6	12439	12444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013159	TCC	2	6	12516	12521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_013159	GCC	2	6	12562	12567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_013159	TCG	2	6	12577	12582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013159	GCC	2	6	12678	12683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_013159	CGT	2	6	12690	12695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013159	GCCG	2	8	12731	12738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013159	CGG	2	6	12775	12780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013159	CAC	2	6	13608	13613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_013159	AGG	2	6	13630	13635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013159	TG	3	6	14097	14102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013159	GGTG	2	8	14117	14124	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013159	CTT	2	6	14390	14395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013159	TGT	2	6	14409	14414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013159	GGC	2	6	14441	14446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013159	CGC	2	6	14774	14779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_013159	CCA	2	6	14820	14825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_013159	CCTT	2	8	14846	14853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013159	CTGG	2	8	14861	14868	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013159	TTGT	2	8	14891	14898	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013159	CTG	2	6	14901	14906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013159	GAT	2	6	14947	14952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013159	CGA	2	6	14994	14999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013159	GAT	2	6	15031	15036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013159	GCG	2	6	15083	15088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013159	GCG	2	6	15104	15109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013159	TCG	2	6	15116	15121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013159	CGG	2	6	15122	15127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013159	TTGC	2	8	15136	15143	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013159	GTG	2	6	15183	15188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013159	CGG	2	6	15221	15226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013159	AGCGGG	2	12	15278	15289	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013159	GTA	2	6	15300	15305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013159	CG	3	6	15330	15335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013159	GTCG	2	8	15783	15790	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013159	GC	3	6	15889	15894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013159	TGT	2	6	15911	15916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013159	ATC	2	6	15955	15960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013159	TCG	2	6	15973	15978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013159	GCC	2	6	16054	16059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_013159	CGAG	2	8	16130	16137	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_013159	GCC	2	6	16138	16143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_013159	CAA	2	6	16212	16217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013159	CCCG	2	8	16232	16239	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_013159	CGT	2	6	16284	16289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013159	CG	3	6	16305	16310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013159	GAA	2	6	16311	16316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013159	CCA	2	6	16352	16357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_013159	GA	3	6	16384	16389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013159	CG	3	6	16397	16402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013159	ACC	2	6	16422	16427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_013159	CGTT	2	8	16448	16455	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013159	CAC	2	6	16902	16907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_013159	CGA	2	6	16922	16927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013159	CCG	2	6	16962	16967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_013159	GTGTTC	2	12	16973	16984	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_013159	CGG	2	6	17105	17110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013159	AAG	2	6	17165	17170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013159	CAC	2	6	17225	17230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_013159	GT	3	6	18609	18614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013159	TCC	2	6	20471	20476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_013159	GCG	2	6	20524	20529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013159	CCA	2	6	20531	20536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_013159	CCGG	2	8	20545	20552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013159	CCA	2	6	20559	20564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_013159	CGA	2	6	20591	20596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013159	GGT	2	6	20749	20754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013159	TCC	2	6	20788	20793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_013159	CGT	2	6	20794	20799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013159	TGT	2	6	20842	20847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013159	TCG	3	9	20861	20869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013159	GAG	2	6	20878	20883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013159	CGG	2	6	21020	21025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013159	GTC	2	6	21029	21034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013159	TCG	2	6	21075	21080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013159	ACGCGC	2	12	21564	21575	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013159	CCGA	2	8	21654	21661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013159	GAG	2	6	22171	22176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013159	TCG	2	6	22211	22216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013159	GC	3	6	22917	22922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013159	GTGAGC	2	12	22930	22941	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_013159	TGG	2	6	22969	22974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013159	TCG	2	6	23656	23661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013159	CG	3	6	23699	23704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013159	CGC	2	6	25171	25176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_013159	CGTC	2	8	25187	25194	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013159	GGCA	2	8	25545	25552	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013159	GAGC	2	8	25564	25571	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013159	TGC	2	6	25588	25593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013159	GGTCG	2	10	25595	25604	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_013159	GAG	2	6	25616	25621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013159	GAG	2	6	25639	25644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013159	CGG	2	6	25723	25728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013159	CCGG	2	8	25762	25769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013159	C	6	6	25802	25807	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
118	NC_013159	CCGG	2	8	25826	25833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013159	GCCG	2	8	25872	25879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013159	GCC	2	6	25884	25889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_013159	C	6	6	25893	25898	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122	NC_013159	CGC	2	6	25916	25921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_013159	CTC	2	6	25922	25927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_013159	CCT	2	6	27808	27813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_013159	CCG	2	6	27814	27819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_013159	CTT	2	6	27820	27825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013159	ACG	2	6	29665	29670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013159	ACC	2	6	30376	30381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_013159	TCT	2	6	32428	32433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013159	CGC	2	6	38798	38803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_013159	GTC	2	6	38813	38818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013159	GCC	2	6	38841	38846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_013159	GAA	2	6	38886	38891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013159	CCT	2	6	40128	40133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_013159	TG	3	6	40138	40143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013159	TGCT	2	8	40210	40217	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_013159	GT	3	6	40286	40291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013159	CTCC	2	8	40314	40321	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
139	NC_013159	ACG	2	6	40333	40338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013159	T	6	6	40370	40375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013159	GT	3	6	40377	40382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013159	GGC	2	6	40437	40442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_013159	GAG	2	6	40467	40472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013159	CTT	2	6	40493	40498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_013159	AGGA	2	8	40512	40519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013159	GTC	2	6	40772	40777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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271	NC_013159	A	6	6	101046	101051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_013159	GAA	2	6	101055	101060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
273	NC_013159	GT	3	6	102813	102818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
274	NC_013159	GCG	2	6	102819	102824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_013159	TCCG	2	8	102828	102835	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
276	NC_013159	CGC	2	6	102841	102846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
277	NC_013159	AC	3	6	103656	103661	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
278	NC_013159	TTCG	2	8	103759	103766	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
279	NC_013159	CTA	2	6	103767	103772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_013159	GAC	2	6	105292	105297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_013159	AGGGG	2	10	105949	105958	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
282	NC_013159	GAT	2	6	105974	105979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_013159	T	6	6	105992	105997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_013159	T	7	7	106036	106042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_013159	GGGA	2	8	107656	107663	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_013159	CGGC	2	8	114016	114023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
288	NC_013159	GC	3	6	114022	114027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
289	NC_013159	GACG	2	8	114035	114042	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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292	NC_013159	GTG	2	6	114150	114155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_013159	CGG	2	6	161414	161419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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427	NC_013159	TCA	2	6	164233	164238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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433	NC_013159	CGG	2	6	170999	171004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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442	NC_013159	CCG	2	6	175840	175845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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461	NC_013159	CCG	2	6	179997	180002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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466	NC_013159	CGG	2	6	182096	182101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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488	NC_013159	CG	3	6	191077	191082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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